Naruto est un ninja en formation dont les pitreries sauvages amusent ses coéquipiers. Mais il ne prend qu'une chose très au sérieux : devenir le plus grand ninja du monde ! Sur l'Île de la Tortue, Naruto et les forces alliées Shinobi se préparent à attaquer Kabuto et Madara. Mais ils rencontrent les hordes de soldats ninja réanimés de Kabuto, et dans le feu de la bataille, Naruto et ses amis alliés réalisent qu'ils se retrouvent face à face avec de vieux amis ramenés d'entre les morts !