Imaginez-vous vous réveiller dans un monde où chaque humain a été mystérieusement transformé en pierre...
Un jour fatidique, toute l’humanité s’est transformée en pierre. Plusieurs millénaires plus tard, Taiju se libère de la pétrification et se retrouve entouré de statues. La situation semble sombre, jusqu'à ce qu'il rencontre son ami Senku, passionné de science ! Ensemble, ils prévoient de relancer la civilisation avec le pouvoir de la science !
La course à travers l'Amérique du Sud commence alors que l'équipe plonge dans la forêt amazonienne, dans l'espoir d'atteindre la source de pétrification. À leur arrivée, Senku et ses amis découvrent une scène tellement pleine de méchanceté que c'en est écoeurant ! Plus profondément en Amazonie, dans ce qu'on appelle le Sanctuaire de Pierre, la bataille finale contre Stanley approche !